Hauptwohnsitz, Nebenwohnsitz --> Doppelte Haushaltsführung in Bayern

Hallo zusammen,
da ich mich im Steuerrecht leider zu wenig auskenne, hätte ich da mal eine Frage an Euch.

Es geht um folgendes:
Seit 01.12.2015 habe ich in München einen unbefristeten Arbeitsvertrag. Parallel zu meiner Arbeit studiere ich und fange spätestens im Februar meine Masterthesis an (auch wieder neben der eigentlichen Arbeit/nebenberuflich).
Sobald die Thesis fertig ist (Ende 2016), plane ich wieder in meine Heimat zu meiner Lebensgefährtin (wir haben zusammen ein EFH) zu ziehen.
Heute war ich im Bürgerbüro der Stadt München und wollte mich mit Nebenwohnsitz anmelden. Dort wurde mir leider mitgeteilt, dass ich, wenn ich mehr als 50% des Jahres in München bin, auch meinen Hauptwohnsitz nach München legen muss.

Diesbezüglich hätte ich jetzt zwei Fragen:
1) Stimmt das mit dem Hauptwohnsitz? Mein letzter Wissensstand war, dass man den Hauptwohnsitz auch an den Lebensmittelpunkt legen kann. Dieser ist ja eindeutig nicht in München.
2) Kann man auch den Hauptwohnsitz (in diesem Fall München und nicht der Lebensmittelpunkt) in Bezug auf die doppelte Haushaltsführung absetzen?

vielen Dank für Eure Hilfe
Michael